在实际分析过程中，液相色谱仪流动相与色谱柱的温度，影响着组分的分离平衡，使用色谱柱温箱的有益。
色谱柱温箱的优点：
1.可以使保留时间相对恒定，对需要进行的定性鉴别可提高其可信度。
2.保留时间的重复性是色谱分析进行定量的基础，这一点在色谱仪检定规程中有严格的要求。不同的保留时间不仅不能判断其成份的一致性，同时，由于保留时间不同峰面积也必将发生变化，其检测结果的可信度将受质疑。
3.温差较大时，因保留时间不稳将增加检测工作的复杂性。
4.温度低的时候，因流动相黏度增加而使检测时间延长，同时增加泵的磨损，影响设备的使用寿命。
5.如果温度过低也可能出现堵塞高压恒流泵、管路、进样阀、色谱柱的现象。其原因就是温度低溶解度相对下降而出现缓冲盐结晶。
6.温度低时还因溶解度下降使杂质吸附在填料上而难于洗脱，从而影响色谱柱的使用寿命。
